MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011989	GTT	2	6	180896	180901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011989	TCGT	2	8	180940	180947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_011989	TC	3	6	181015	181020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_011989	ACAA	2	8	181181	181188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_011989	CTT	2	6	181233	181238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_011989	CGG	2	6	181242	181247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011989	CAA	2	6	181358	181363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147169
3508	NC_011989	CAT	2	6	181409	181414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147169
3509	NC_011989	AGGAT	2	10	181471	181480	40 %	20 %	40 %	0 %	222147169
3510	NC_011989	GTTCTG	2	12	181491	181502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222147169
3511	NC_011989	TGGA	2	8	181518	181525	25 %	25 %	50 %	0 %	222147169
3512	NC_011989	GTT	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147169
3513	NC_011989	TTG	2	6	181611	181616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147169
3514	NC_011989	GC	3	6	181619	181624	0 %	0 %	50 %	50 %	222147169
3515	NC_011989	TGG	2	6	181846	181851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147169
3516	NC_011989	CGT	2	6	181910	181915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147169
3517	NC_011989	TCCT	2	8	181967	181974	0 %	50 %	0 %	50 %	222147170
3518	NC_011989	TCGG	2	8	182009	182016	0 %	25 %	50 %	25 %	222147170
3519	NC_011989	TCA	2	6	182025	182030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147170
3520	NC_011989	GCG	2	6	182160	182165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3521	NC_011989	GCGGTC	2	12	182206	182217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147170
3522	NC_011989	CG	3	6	182279	182284	0 %	0 %	50 %	50 %	222147170
3523	NC_011989	TGC	2	6	182310	182315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3524	NC_011989	ATC	2	6	182363	182368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147170
3525	NC_011989	GCG	2	6	182468	182473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3526	NC_011989	GGT	2	6	182488	182493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147170
3527	NC_011989	GATG	2	8	182557	182564	25 %	25 %	50 %	0 %	222147170
3528	NC_011989	GAG	2	6	182597	182602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147170
3529	NC_011989	GCA	2	6	182713	182718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3530	NC_011989	CCG	2	6	182727	182732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147170
3531	NC_011989	GCC	2	6	182795	182800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147170
3532	NC_011989	CCT	2	6	182997	183002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147170
3533	NC_011989	CG	3	6	183017	183022	0 %	0 %	50 %	50 %	222147170
3534	NC_011989	GAT	2	6	183043	183048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147170
3535	NC_011989	TGA	2	6	183058	183063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147170
3536	NC_011989	GCA	2	6	183091	183096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3537	NC_011989	TGC	2	6	183099	183104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3538	NC_011989	GGC	2	6	183134	183139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3539	NC_011989	CGG	2	6	183184	183189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3540	NC_011989	GGC	2	6	183218	183223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3541	NC_011989	TCC	2	6	183535	183540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147171
3542	NC_011989	AAG	2	6	183544	183549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147171
3543	NC_011989	GCT	2	6	183583	183588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147171
3544	NC_011989	TCA	2	6	183686	183691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147171
3545	NC_011989	GCC	2	6	183814	183819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147172
3546	NC_011989	GCC	2	6	183833	183838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147172
3547	NC_011989	CAA	2	6	183912	183917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147172
3548	NC_011989	CAA	2	6	184005	184010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147172
3549	NC_011989	CCAT	2	8	184052	184059	25 %	25 %	0 %	50 %	222147172
3550	NC_011989	GC	3	6	184076	184081	0 %	0 %	50 %	50 %	222147172
3551	NC_011989	AAG	2	6	184096	184101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147172
3552	NC_011989	T	6	6	184224	184229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011989	GGC	2	6	184294	184299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_011989	GAC	2	6	184317	184322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011989	CGC	2	6	184368	184373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3556	NC_011989	CGA	2	6	184380	184385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3557	NC_011989	GCC	2	6	184411	184416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3558	NC_011989	GCC	2	6	184495	184500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3559	NC_011989	GAA	2	6	184512	184517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3560	NC_011989	AAG	2	6	184543	184548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3561	NC_011989	GCC	2	6	184564	184569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3562	NC_011989	GC	3	6	184576	184581	0 %	0 %	50 %	50 %	222147173
3563	NC_011989	TCAG	2	8	184655	184662	25 %	25 %	25 %	25 %	222147173
3564	NC_011989	TTC	2	6	184801	184806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3565	NC_011989	TGC	2	6	184838	184843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3566	NC_011989	GCC	2	6	184890	184895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3567	NC_011989	GAA	2	6	185026	185031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3568	NC_011989	CTT	2	6	185043	185048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3569	NC_011989	CTT	2	6	185085	185090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3570	NC_011989	TGGA	2	8	185176	185183	25 %	25 %	50 %	0 %	222147173
3571	NC_011989	TGC	2	6	185216	185221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3572	NC_011989	GC	3	6	185220	185225	0 %	0 %	50 %	50 %	222147173
3573	NC_011989	GGC	2	6	185227	185232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147173
3574	NC_011989	CTT	2	6	185322	185327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3575	NC_011989	TGG	2	6	185391	185396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147173
3576	NC_011989	TGT	2	6	185468	185473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011989	AGA	2	6	185502	185507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011989	GA	3	6	185506	185511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011989	ATG	2	6	185560	185565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011989	GAA	2	6	185672	185677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011989	TGA	2	6	185684	185689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011989	TAC	2	6	185714	185719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_011989	TGA	2	6	185725	185730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011989	GA	3	6	185813	185818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011989	TGA	2	6	185929	185934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3586	NC_011989	GGC	2	6	185938	185943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3587	NC_011989	CATC	2	8	185987	185994	25 %	25 %	0 %	50 %	222147174
3588	NC_011989	TC	3	6	186013	186018	0 %	50 %	0 %	50 %	222147174
3589	NC_011989	GCG	2	6	186057	186062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3590	NC_011989	GCGG	2	8	186073	186080	0 %	0 %	75 %	25 %	222147174
3591	NC_011989	ATGT	2	8	186110	186117	25 %	50 %	25 %	0 %	222147174
3592	NC_011989	ATG	2	6	186176	186181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3593	NC_011989	CGC	2	6	186265	186270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147174
3594	NC_011989	TGA	2	6	186283	186288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3595	NC_011989	GAT	2	6	186292	186297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3596	NC_011989	GCC	2	6	186362	186367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147174
3597	NC_011989	AGC	2	6	186387	186392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147174
3598	NC_011989	AGCTGG	2	12	186441	186452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222147174
3599	NC_011989	ATG	2	6	186453	186458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3600	NC_011989	TGG	2	6	186573	186578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3601	NC_011989	CATG	2	8	186616	186623	25 %	25 %	25 %	25 %	222147174
3602	NC_011989	GTG	2	6	186731	186736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3603	NC_011989	GGC	2	6	186767	186772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3604	NC_011989	GCG	2	6	186780	186785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3605	NC_011989	TTGA	2	8	186821	186828	25 %	50 %	25 %	0 %	222147174
3606	NC_011989	CGCT	2	8	186869	186876	0 %	25 %	25 %	50 %	222147174
3607	NC_011989	CAT	2	6	186880	186885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147174
3608	NC_011989	AT	3	6	186928	186933	50 %	50 %	0 %	0 %	222147174
3609	NC_011989	CAC	2	6	186952	186957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147174
3610	NC_011989	GCG	2	6	186978	186983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3611	NC_011989	GGT	2	6	187003	187008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3612	NC_011989	CGA	2	6	187090	187095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147174
3613	NC_011989	GGGCGA	2	12	187135	187146	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222147174
3614	NC_011989	CAT	2	6	187167	187172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147174
3615	NC_011989	GGC	2	6	187173	187178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3616	NC_011989	AGA	2	6	187207	187212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147174
3617	NC_011989	CAC	2	6	187291	187296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147174
3618	NC_011989	CCGCAC	2	12	187306	187317	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222147174
3619	NC_011989	ATG	2	6	187346	187351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3620	NC_011989	TTTG	2	8	187393	187400	0 %	75 %	25 %	0 %	222147174
3621	NC_011989	GGC	2	6	187403	187408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3622	NC_011989	TGC	2	6	187438	187443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147174
3623	NC_011989	GCT	2	6	187468	187473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147174
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3987	NC_011989	GCA	2	6	205632	205637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_011989	TGC	2	6	205688	205693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147194
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3991	NC_011989	CGC	2	6	205793	205798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147194
3992	NC_011989	TGGC	2	8	205857	205864	0 %	25 %	50 %	25 %	222147194
3993	NC_011989	GGC	2	6	205884	205889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147194
3994	NC_011989	ATC	2	6	205958	205963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147194
3995	NC_011989	GAT	2	6	206003	206008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147194
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3997	NC_011989	CTT	2	6	206039	206044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147194
3998	NC_011989	GCC	2	6	206069	206074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147194
3999	NC_011989	ATC	2	6	206130	206135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147194
4000	NC_011989	TGT	2	6	206158	206163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147194

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